Critères de l'offre
Métiers :
- Ingénieur en informatique (H/F)
Expérience min :
- débutant à 1 an
Diplômes :
- Bac+5
Compétences :
- Anglais
- Bash
- Linux unix
- Cluster
- Python
- + 2 compétences
Lieux :
- Plouzané (29)
Conditions :
- Intérim
- Temps Plein
Description du poste
Manpower BREST TERTIAIRE recherche pour son client, basé à Plouzané, un Ingénieur bio-informatique (H/F) Rattaché(e) au chef du service de bio?informatique (SeBiMER), vous rejoignez une équipe dynamique pour renforcer ses activités de développement et de gestion de données.
Vos missions :
En collaboration avec les équipes de biologistes d'Ifremer, vous serez chargé(e) de?:
- Améliorer le protocole interne de gestion de données bioinformatiques egide?athENA (Python, Nextflow).
- Contribuer à la gestion FAIR des données bioinformatiques de l'institut
- Participer au support bioinformatique général auprès des équipes de recherche
- Développer et maintenir egide (Python) : correction de bugs, nouvelles fonctionnalités, gestion de métadonnées selon les standards EN
- Développer et maintenir athENA (Nextflow) : validation et publication de métadonnées à l'ENA
- Assurer la gestion FAIR des données : récupération des données de séquençage, organisation sur DATARMOR, validation et soumission des métadonnées, suivi via athENA?manager
- Accompagner les équipes de recherche : support technique et rédaction de documentation
Formation : Bac+5 en bioinformatique ou informatique
Compétences techniques :
- Python (indispensable) et librairies associées (openpyxl, pysam, pyfastx, pandas, numpy).
- Bash et connaissance de Nextflow
- Git/GitLab et outils de collaboration
- Environnement Unix/Linux et clusters de calcul
- Bon niveau d'anglais technique
Qualités personnelles :
- Organisation, autonomie, sens du service
- Aisance relationnelle et travail en équipe
- Excellentes capacités de communication écrite (français et anglais)
Dans le cadre de sa politique diversité, Manpower étudie, à compétences égales, toutes candidatures dont celles de personnes en situation de handicap
Vos missions :
En collaboration avec les équipes de biologistes d'Ifremer, vous serez chargé(e) de?:
- Améliorer le protocole interne de gestion de données bioinformatiques egide?athENA (Python, Nextflow).
- Contribuer à la gestion FAIR des données bioinformatiques de l'institut
- Participer au support bioinformatique général auprès des équipes de recherche
- Développer et maintenir egide (Python) : correction de bugs, nouvelles fonctionnalités, gestion de métadonnées selon les standards EN
- Développer et maintenir athENA (Nextflow) : validation et publication de métadonnées à l'ENA
- Assurer la gestion FAIR des données : récupération des données de séquençage, organisation sur DATARMOR, validation et soumission des métadonnées, suivi via athENA?manager
- Accompagner les équipes de recherche : support technique et rédaction de documentation
Formation : Bac+5 en bioinformatique ou informatique
Compétences techniques :
- Python (indispensable) et librairies associées (openpyxl, pysam, pyfastx, pandas, numpy).
- Bash et connaissance de Nextflow
- Git/GitLab et outils de collaboration
- Environnement Unix/Linux et clusters de calcul
- Bon niveau d'anglais technique
Qualités personnelles :
- Organisation, autonomie, sens du service
- Aisance relationnelle et travail en équipe
- Excellentes capacités de communication écrite (français et anglais)
Dans le cadre de sa politique diversité, Manpower étudie, à compétences égales, toutes candidatures dont celles de personnes en situation de handicap
Date de début : 23/03/2026
Durée du contrat : 6 mois
Référence : 1101401490

